Repository of Research and Investigative Information

Repository of Research and Investigative Information

Hormozgan University of Medical Sciences

Research project #5414

(1395) شناسائی ایزوله های بالینی کلبسیلا پنومونیه مقاوم به کارباپنم و تشخیص ملکولی ژنهای کارباپنماز KPC, IMP, VIM, NDM, OXA-48 and OXA-181 با استفاده از روش PCR. completed.

[img] Text
گزارش نهایی طرح کلبسیلا.pdf
Restricted to Registered users only

Download (1MB)

Persian Abstract

زمینه و هدف: گسترش کلبسیلا پنومونیه مقاوم به کارباپنم یکی از مهمترین نگرانی ها و معضلات بهداشتی در سراسر دنیاست. سویه هایی از این باکتری که حاوی ژن متالوبتالاکتاماز NDM-1 می باشند بسیار مورد توجه قرار گرفته اند. هدف از مطالعه حاضر تعیین میزان شیوع کلبسیلا پنومونیه مقاوم به کارباپنم در سه بیمارستان آموزشی شهر بندرعباس با استفاده از روشهای فنوتیپی و مشخص نمودن ایزوله های تولید کننده ی کارباپنماز و انواع مختلف این ژنها است. روش کار: در طی زمان مطالعه از تیر ماه 4931 تا آذر ماه 4931 تعداد 471 ایزوله بالینی کلبسیلا پنومونیه از نمونه های بیماران مراجعه کننده به بیمارستانهای شهید محمدی، دکتر شریعتی و کودکان مطالعه شدند. ژنهای کارباپنماز blaKPC, blaIMP, blaVIM, blaSPM, blaOxa-48 and blaOxa-181 با استفاده از روش PCR مورد جستجو قرار گرفتند. تستهای فنوتیپی نظیر Modified Hodge test و Triton Hodge test برای شناسائی تولید کارباپنمازها انجام شدند. تست دیسک مروپنم و برونیک اسید جهت شناسائی ایزوله های تولید کننده KPC انجام گردید. همزمان تست اطلاعات طرح شناسائی ایزوله های بالینی کلبسیلا پنومونیه مقاوم به کارباپنم و تشخیص ملکولی ژنهای کارباپنماز KPC, IMP, VIM, NDM, OXA-48 and OXA-181 با استفاده از روش PCR عنوان طرح دکتر سعید شجاع مجری دکتر افسانه کرمستجی، دکتر پریوش داوودیان، دکتر صدیقه جوادپور، فروغ فریدی، مریم انصاری و محسن آزاد همکاران اصلی مرکز تحقیقات بیماریهای عفونی و گرمسیری/ پژوهشکده سلامت مرکز تحقیقاتی/ دانشکده تیر ماه 4931 زمان شروع تحقیق آذر ماه 4931 زمان خاتمه تحقیق 410914111 بودجه مصوب منابع تأمین بودجه 2 و Dipicolinic acid EDTA به منظور شناسائی تولید متالوبتالاکتاماز انجام پذیرفت. جهت بررسی ارتباط کلونال باکتری های تولید کننده ی NDM-1 با روش Multilocus Sequence Typing (MLST) مورد مطالعه قرار گرفتند. ایزوله های حاوی NDM-1 از جهت وجود ژنهای ESBL با استفاده از روش PCR بررسی شدند. یافته ها: از بین 471 ایزوله مورد مطالعه تعداد 1 ایزوله کلبسیلا پنومونیه حاوی ژن NDM-1 بودند ) ایزوله های A تا D .) هیچ کدام از دیگر ژنهای کارباپنماز در بین ایزوله ها یافت نشد. نتایج MLST نشان داد که ایزوله ها از لحاظ اپیدمیولوژیکی با هم مرتبط بوده و متعلق به دو کلون ST13 و ST 392 می باشند. ایزوله A علاوه بر ژن NDM-1 حاوی ژنهای SHV-11, CTX-M-15 و TEM-1 بود. ایزوله B ژنهای SHV-11 و CTX-M-15 را حمل می نمود و ایزوله های C و D نیز حاوی ژنهای SHV-1 و CTX-M-15 بودند. حساسیت و اختصاصیت روش Modified Hodge test برای شناسائی ایزوله های NDM-1 مثبت 411 % بود. روش Triton Hodge test, EDTA و Dipicolinic acid 31 درصد برای شناسائی ایزوله / دارای حساسیتی معادل 411 درصد و اختصاصیت 70 های تولید کننده NDM-1 داشتند. همچنین دیسک برونیک اسید دارای حساسیت و اختصاصیتی معادل 411 % برای شناسائی ایزوله های تولید کننده KPC داشت. نتیجه گیری: در مطالعه حاضر 1 ایزوله دارای ژن NDM-1 بودند. یکی از مهمترین نگرانی های ما این است که ایزوله های مقاوم در این مطالعه که متعلق به ST13 و ST 392 هستند در آینده ای نزدیک در بیمارستانهای ما شایع شده و به صورت اندمیک شوند. نتیجه تست های فنوتیپی نشان داد که این تست ها برای شناسائی ایزوله های تولید کننده کارباپنماز مفید هستند اما هیچ کدام قادر نیستند بین انواع ژنها افتراق قائل شوند و بر طبق این نتایج به نظر می رسد که PCR همچنان به عنوان استاندارد طلائی جهت شناسائی کارباپنمازها بویژه NDM-1 باقی می ماند. شناسائی سریع ایزوله های تولید کننده NDM-1 و کنترل این باکتریها نقش بسیار موثری در جهت کنترل و جلوگیری از انتشار آنها خواهد داشت.

Title

Identification of clinical isolates of carbapenem resistant Klebsiella pneumonia and molecular characterisation of carbapenemase gene KPC, IMP, VIM, NDM, OXA-48 and OXA-181 with PCR Method

Abstract

Background and Objective: The spread of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae harboring New Delhi metallo-β-lactamase (NDM-1) is a great concern worldwide. The aim of present study was to determine the rate of carbapenem resistant klebsiella pneumoniae in three teaching hospitals at Bandar Abbas by phenotypic and genotypic methods. Materials and Methods: During the study period from June 2015 to November 2016 a total of 170 non-repetitive clinical isolates of Klebsiella pneumoniae were investigated for carbapenem resistance genes including blaNDM-1. We evaluated, Modified Hodge Test (MHT) and Triton Hodge Test (THT), dipicolinic acid (DPA) and EDTA disc synergy test for phenotypic detection of NDM-1 producing isolates. Bronic acid disk synergy was used evaluate KPC producing isolates. Clonal relatedness of NDM-1 positive isolates was investigated by Multilocus Sequence Typing (MLST). Results: Four carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (isolate A to D) were blaNDM-1 positive and all were multidrug-resistant. MLST revealed that NDM-1 positive isolates were clonally related and were belonged to two distinct clonal complexes: ST13 and ST392. In addition to blaNDM-1, isolate A co-harbor SHV-11, CTX-M-15 and TEM-1, isolate B harbored SHV-11 and CTX-M-15, isolates C and D contained SHV-1 and CTX-M-15. The sensitivity and specificity of Modified Hodge test was 100% in detection of NDM-1 producing isolates. Triton Hodge Test (THT), dipicolinic acid (DPA) and EDTA disc synergy had 100% sensitivity and 95.78% specificity for identification of NDM-1 producing isolates. Bronic acid disk synergy had 100% sensitivity and specificity in determination of KPC producing isolates. 27 Conclusion: One of our major concerns is that NDM-1 producing Klebsiella pneumoniae ST13 and ST392 are disseminated in our hospitals and may be more prevalent in the near future. Indeed, PCR remains the gold standard and useful method for detection of NDM-1 positive isolates. Tracing and urgent intervention is necessary for control and prevention of these resistant isolates

Item Type: Research project
Subjects: QU Biochemistry. Cell Biology and Genetics > QU 300-560 Cell Biology and Genetics
QW Microbiology and Immunology > QW 1-300 Microbiology
Divisions: Research Vice-Chancellor Department > Infectious and Tropical Diseases Research Center
Depositing User: مركز تحقيقات بيماريهاي عفوني
URI: http://eprints.hums.ac.ir/id/eprint/5414

Actions (login required)

View Item View Item